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研究开发

《自然》子刊揭示“垃圾DNA”新功能:有助于化疗后血液再生

来源:学术经纬作者:未知时间:2021-07-16

人类基因组里,编码蛋白质的DNA大约仅占1%。至于剩下99%的DNA片段有啥功能,引起了长期的争论。除了已知一小部分起着调控作用,大量还没有被发现特殊功能的DNA片段,被人们简单粗暴地归为“垃圾DNA”。

《自然》子刊Nature Cell Biology上,近日发表了一篇有关“垃圾DNA”与血液再生的研究论文。德国马克斯·普朗克研究所、英国牛津大学等机构的科学家合作发现,在化疗之后,骨髓中的造血干细胞(HSC)会利用“垃圾DNA”转录产生的RNA分子增强活化,产生新鲜细胞,促进血液再生。

化疗是治疗癌症广泛使用的一种方法。化疗药物通过干扰各种生化过程杀死癌细胞,或抑制癌细胞的生长。但化疗对细胞的破坏除了影响癌细胞外,理论上也影响许多其他类型的细胞,包括血液循环中的多种血细胞。

因此,化疗之后,造血系统备受压力,不得不积极造血,以补充失去的血细胞。作为造血系统的源头,造血干细胞可以产生包括免疫细胞在内的大多数血细胞。正常情况下,造血干细胞待在骨髓中以休眠状态保存实力,但在化疗后,它们转为活跃状态,开始增殖和分化。

在这项研究中,科学家们揭示了化疗反应激活造血干细胞的过程。研究人员注意到,在此过程中,一类被称为“转座元件”的垃圾DNA起到了重要作用。

转座元件(简称TE)指的是可以在基因组中移动的DNA片段。它们看上去是病毒或细菌等病原体遗留下来的产物,经过数百万年的进化,融入了我们的基因组。

研究人员发现,化疗后,造血干细胞转录产生的RNA分子中,除了来自编码基因的“典型”RNA外,还有一部分来自TE转录产生的RNA。

这些RNA分子引起了科学家的好奇:化疗后出现的炎症信号增强与这些非典型RNA分子有关吗?因为造血干细胞上有一些受体可以诱导炎症,而这些受体的已知作用是感知病毒RNA。“我们假设,这些受体也许还可以结合转座元件的RNA。” 共同第一作者Aikaterini Polyzou博士解释说。

这一假设在后续实验中得到了验证。研究人员发现,转座元件RNA可以激活免疫受体MDA5,引发炎症反应,从而促使造血干细胞退出休眠状态,进入增殖状态。实验显示,如果没有转座元件RNA与MDA5的相互作用,造血干细胞的激活会变慢,效率变低。换句话说,对于化疗后的特殊时期,这些垃圾DNA产生的RNA分子有助于促进必需的血液再生。

▲研究示意图:转座元件产生的RNA与免疫受体MDA5结合,引发炎症反应,促使造血干细胞增殖(图片来源:参考资料[1];绘图:BioRender.com)

造血干细胞的变化还提示研究人员,细胞在应对压力或需要改变状态时——例如在发育和衰老过程中,这类转座元件或其他类似RNA分子的参与或许不是个例,可能是一种进化适应。


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